Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Snx29Q9D3S3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx29Q9D3S3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx29Q9D3S3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms