Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rufy3Q9D394 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rufy3Q9D394 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms