Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrnp35Q9D384 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrnp35Q9D384 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrnp35Q9D384 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms