Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Q9D2Q3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9D2Q3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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