Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Nol3Q9D1X0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nol3Q9D1X0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms