Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo1Q9D1T0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo1Q9D1T0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo1Q9D1T0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo1Q9D1T0 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo1Q9D1T0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lingo1Q9D1T0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lingo1Q9D1T0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lingo1Q9D1T0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lingo1Q9D1T0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lingo1Q9D1T0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lingo1Q9D1T0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Lingo1Q9D1T0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lingo1Q9D1T0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms