Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl34Q9D1R9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl34Q9D1R9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl34Q9D1R9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl34Q9D1R9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl34Q9D1R9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl34Q9D1R9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl34Q9D1R9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl34Q9D1R9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rpl34Q9D1R9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpl34Q9D1R9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpl34Q9D1R9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms