Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Lmbr1lQ9D1E5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lmbr1lQ9D1E5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms