Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms