Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mdm1Q9D067 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mdm1Q9D067 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mdm1Q9D067 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mdm1Q9D067 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mdm1Q9D067 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mdm1Q9D067 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms