Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Polr3eQ9CZT4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Polr3eQ9CZT4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms