Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Utp11Q9CZJ1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Utp11Q9CZJ1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms