Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl35Q9CZ49 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl35Q9CZ49 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms