Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prelid3bQ9CYY7 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prelid3bQ9CYY7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prelid3bQ9CYY7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms