Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CYI0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CYI0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYI0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CYI0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CYI0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Q9CYI0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CYI0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms