Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms