Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Tmed5Q9CXE7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Tmed5Q9CXE7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tmed5Q9CXE7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms