Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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Prdm5Q9CXE0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm5Q9CXE0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm5Q9CXE0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm5Q9CXE0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm5Q9CXE0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Prdm5Q9CXE0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Prdm5Q9CXE0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Prdm5Q9CXE0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm5Q9CXE0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Prdm5Q9CXE0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Prdm5Q9CXE0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Prdm5Q9CXE0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Prdm5Q9CXE0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Prdm5Q9CXE0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Prdm5Q9CXE0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm5Q9CXE0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm5Q9CXE0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm5Q9CXE0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm5Q9CXE0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm5Q9CXE0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm5Q9CXE0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm5Q9CXE0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Prdm5Q9CXE0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm5Q9CXE0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm5Q9CXE0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm5Q9CXE0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm5Q9CXE0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm5Q9CXE0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm5Q9CXE0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm5Q9CXE0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm5Q9CXE0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm5Q9CXE0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Prdm5Q9CXE0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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