Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mgme1Q9CXC3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Mgme1Q9CXC3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mgme1Q9CXC3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms