Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cxxc1Q9CWW7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cxxc1Q9CWW7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms