Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnnbl1Q9CWL8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnnbl1Q9CWL8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
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