Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NubplQ9CWD8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms