Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Smc3Q9CW03 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smc3Q9CW03 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms