Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Klhl28Q9CR40 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Klhl28Q9CR40 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Klhl28Q9CR40 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms