Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR34

Uncharacterized protein C5orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR34 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR34 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR34 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR34 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR34 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR34 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR34 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CR34 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CR34 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR34 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR34 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR34 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR34 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR34 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR34 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR34 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR34 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CR34 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR34 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR34 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR34 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR34 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR34 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR34 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9CR34 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9CR34 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q9CR34 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q9CR34 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CR34 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CR34 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CR34 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CR34 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CR34 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CR34 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CR34 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CR34 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CR34 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q9CR34 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q9CR34 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms