Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR26

Vta1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vta1Q9CR26 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vta1Q9CR26 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vta1Q9CR26 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vta1Q9CR26 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms