Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
4931417E11RikQ9CR05 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
4931417E11RikQ9CR05 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms