Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ifitm3Q9CQW9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ifitm3Q9CQW9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms