Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Riok2Q9CQS5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Riok2Q9CQS5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Riok2Q9CQS5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Riok2Q9CQS5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok2Q9CQS5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Riok2Q9CQS5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms