Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd5Q9CQP3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Chchd5Q9CQP3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Chchd5Q9CQP3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Chchd5Q9CQP3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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