Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Mrpl35Q9CQL6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mrpl35Q9CQL6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Mrpl35Q9CQL6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl35Q9CQL6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Mrpl35Q9CQL6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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