Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccer1Q9CQL2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccer1Q9CQL2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccer1Q9CQL2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms