Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rwdd1Q9CQK7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rwdd1Q9CQK7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1081.4 ms