Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rdm1Q9CQK3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Rdm1Q9CQK3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rdm1Q9CQK3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms