Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ndufb9Q9CQJ8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ndufb9Q9CQJ8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms