Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DenrQ9CQJ6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DenrQ9CQJ6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DenrQ9CQJ6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms