Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf2Q9CQJ4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf2Q9CQJ4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms