Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI6

Cotl1, Coactosin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cotl1Q9CQI6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cotl1Q9CQI6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cotl1Q9CQI6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms