Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tmed6Q9CQG0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tmed6Q9CQG0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms