Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE6

Asf1a, Histone chaperone ASF1A, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1aQ9CQE6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Asf1aQ9CQE6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Asf1aQ9CQE6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.5 ms