Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nipsnap3bQ9CQE1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms