Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc5Q9CQA1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc5Q9CQA1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms