Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA0

Cenpm, Centromere protein M, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpmQ9CQA0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CenpmQ9CQA0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpmQ9CQA0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms