Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
1700029P11RikQ9CQ68 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms