Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NenfQ9CQ45 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NenfQ9CQ45 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NenfQ9CQ45 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms