Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Nup155Q99P88 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Nup155Q99P88 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nup155Q99P88 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms