Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Acss1Q99NB1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Acss1Q99NB1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms