Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pcgf6Q99NA9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pcgf6Q99NA9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pcgf6Q99NA9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pcgf6Q99NA9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms