Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atoh8Q99NA2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atoh8Q99NA2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atoh8Q99NA2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atoh8Q99NA2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atoh8Q99NA2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atoh8Q99NA2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atoh8Q99NA2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atoh8Q99NA2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atoh8Q99NA2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Atoh8Q99NA2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atoh8Q99NA2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atoh8Q99NA2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atoh8Q99NA2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atoh8Q99NA2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms