Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Brms1Q99N20 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Brms1Q99N20 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms